Né dans une famille de voyageurs, aux origines brassées, Yoan Fernandez a d’abord été formé à la guitare classique et flamenco mais c’est suite à sa rencontre avec Sylvain Luc qu’il décide de se consacrer au jazz.
Il obtient un DEM JAZZ au conservatoire de Perpignan où il étudie avec Serge Lazarevich. Il se perfectionne ensuite avec Louis Martinez, Pierre de Bethman, François Théberge, Peter Giron et Stéphane Foucher.
Il crée le Yoan Fernandez Trio puis il rejoint différentes formations telles que le Faby Medina Quintet et le Viktorija Gecyte Trio.
Il joue également à New York et collabore avec des musiciens comme Ari Koenig, Magic Malik, Steve Coleman, Dave Liebman et Aka Moon.
S’intéressant à la musique brésilienne, il prend part à la création de Morenka, quartet de musiques du monde en 2015 et au duo de musiques d’Amérique Latine « Volver » avec Lara Phanalasy en 2017.